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随着合成树脂的工艺改，使用聚合材料填装的色谱柱可以达到超过100,000plates/m的柱效。此外，在特定的应用中，相对硅胶基质材料，对更极端的pH条件、缓冲盐等添加剂，聚合物比硅填料具有明显的优势。聚合树脂广泛适用于氨基酸、多肽、小分子的纯化和分析蛋白质，如胰岛素、有机酸、碳水化合物和无机阳离子和阴离子。
优点
①刚性聚合物骨架确保的压力流量性能；
②较高的线性操作流速可用于更快的工艺产量并减少循环时间；
③宽pH适用范围，运行条件pH1-14都非常稳定；
④高分辨率、高柱效和高回收率；
⑤高批间重现性，易于放大；
⑥的生物相容性，可忽略的非特异性吸附。
离子交换是利用离子交换树脂（固体相）与溶液（液体相）中的离子之间所发生的交换反应来进行分离的；树脂对离子的亲和力反映了离子在树脂上的交换能力，水合离子的半径越小，电荷越高，其亲和力也越大。将含有不同离子的溶液通过离子交换树脂，树脂将根据对这些离子的不同亲和力，将其依此吸附在树脂的基团上，以实现色谱的分离。
